Andrei Nistor a anunțat demisia din funcția de prefect al Capitalei, decizia fiind luată imediat după numirea lui Marian Neacșu în cadrul noului guvern. Ex-prefectul a criticat dur alegerea politică, descriind numirea unui persoană cu antecedente judiciare ca fiind o „sfidare” pentru integritatea oamenilor decenți din cadrul Ministerului Afacerilor Interne. Nistor a subliniat că speră ca noua nominalizare pentru postul de prefect să fie una a unei persoane responsabile.
Controversa a izbucnit după ce Marian Neacșu a fost desemnat ministru de Interne și vicepremier în guvernul condus de Luca Niculescu. Neacșu a fost condamnat definitiv în 2016 de Înalta Curte de Casație și Justiție la șase luni de închisoare cu suspendare pentru conflict de interese. Deși Radu Marinescu (PSD) a explicat în 2025 că Neacșu a fost reabilitat juridic, decizia politică a generat reacții aprinse din partea lui Andrei Nistor.
Premierul Luca Niculescu a apărat numirea lui Marian Neacșu, afirmând că acesta este un om competent în administrația română. Niculescu a menționat că Neacșu a ocupat funcția de ministru în numeroase guverne din ultimii ani și va ocupa și rolul de vicepremier. Guvernul condus de Luca Niculescu a fost investit în Parlament marți, primind sprijinul a 280 de voturi din partea partidelor PSD, PNL și UDMR.
În urma demisiei, Andrei Nistor a propus soluții pentru continuarea proiectelor de digitalizare și pentru rezolvarea crizei locative a instituției. Acesta a menționat că soluția tehnică pentru digitalizare este deja aleasă și fondurile au fost obținute de la PMB. De asemenea, a criticat plata chiriei de 50.000 euro lunar către RAAPPS, propunând mutarea Prefecturii în fosta Primărie S5 sau în sediul PMB.
Andrei Nistor a transmis mesaje de mulțumire colegilor săi din cadrul Prefecturii, menționând că instituția a trecut prin reorganizări și situații de urgență. El a subliniat profesionalismul funcționarilor și a solicitat ca noul prefect să nu îi încurce în activitatea lor. Nistor s-a oferit să ofere sprijin gratuit pentru implementarea proiectelor rămase în lucru, în cazul în care va fi necesar.
Guvernul condus de Luca Niculescu operează într-un context de stabilitate parlamentară, având susținerea majorității partidelor de la guvernare. Această configurație politică, bazată pe voturile PSD, PNL și UDMR, permite implementarea deciziilor de guvern fără opoziție parlamentară majoră. Această structură de putere este esențială pentru gestionarea ministerelor cheie, precum cel de Interne, în perioada de tranziție administrativă.